Module 4.1.1 : De l’organisme à l’agrosystème : Biologie Moléculaire
- CM de Génie génétique: Techniques d’analyse et de modification des acides nucléiques. Méthodes d’analyses : Electrophorèse, PCR, RT PCR, qPCR, séquençage, Southern blot, Northern blot, Microarray. Outils enzymatiques. Clonage et vecteurs de clonage. Applications
- TP : Analyse moléculaire de tabac transformés par Agrobacterium tumefaciens (culture in vitro, régénération de plants, extraction d’ADN, Dot-blot, Southern-blot, PCR)

Module 4.1.2 : Lutte conventionnelle contre les ravageurs et adventices
- CM : Les Méthodes de Lutte chimique contre les ravageurs des cultures & adventices
- TP : Etude de la résistance de pucerons à des insecticides (analyse microsatellites par PCR)
- TP : Etapes de mise au point de molécules phytosanitaires, Efficacité, sélectivité, Mode de traitement (prélevée, post levée).

Module 4.1.3 : Agriculture durable-Bio - Méthodes alternatives 
- CM : Interactions microorganismes-plantes-sol : Symbioses fixatrices d’azote : Rhizobium-Légumineuses, Frankia-pantes actinorhiziennes : partenaires impliqués, mécanismes moléculaires de l’interaction, biochimie de l’interaction, génétique. Symbioses mycorhiziennes : partenaires impliqués, mécanismes moléculaires de l’interaction. Associations rhizosphériques : bactéries phytobénéfiques (PGPR).
- Les méthodes alternatives de lutte : contre les ravageurs des cultures  (la lutte culturale, la lutte physique, la lutte biologique, les méthodes biotechniques de lutte). Utilisation des auxiliaires des cultures dans les méthodes de lutte biologique.
- Etude du devenir des herbicides dans l’environnement après application - Relations entre les propriétés physico-chimiques d’un sol et propriétés physico-chimiques d’une molécule.
- Amélioration d’une plante horticole 2 : mutagenèse sur pétunia et analyses chromatographiques des pigments floraux.

Module 4.1.4 : Sciences et techniques de l’expérimentation animale
- Cours : Notion de modèles et de réactifs biologiques en expérimentation animale. Cas d’études : modèles pour l’étude de l’hypertension artérielle et du diabète. Cas particulier des études populationnelles et des modèles issus de la faune sauvage : aspects réglementaires et pratiques. Maintien et contrôle du statut sanitaire en animalerie, techniques d’autopsie.
- Les différentes étapes préalables à l’obtention d’une AMM d’un vaccin
- TP : Réalisation d’un test de toxicité embryo-foetale sur rat.

Module 4.1.5 : Productions animales
- CM : Maîtrise de la reproduction Animale : Physiologie de la reproduction et reproduction assistée chez les animaux de rente et les rongeurs.
- CM : Pathologie des maladies infectieuses animales : Rôle du vétérinaire. Notion de causalité en pathologie (agent pathogène). La démarche diagnostique et les outils spécifiques en médecine vétérinaire. Le prélèvement et son conditionnement pour le diagnostic expérimental. Les anti-infectieux vétérinaires. La transmission et la propagation des microbes. La prophylaxie sanitaire et médicale. Etudes de cas et exemples d’application, notamment les mammites comme exemple d’une pathologie infectieuse multi-factorielle.
- TD/TP : Techniques de chirurgie : transfert d’embryons chez la rate.

Module 4.1.6 : Productions végétales : phytopathologie
- Cours phytopathologie : Types d’agents infectieux. Mécanismes impliqués dans la relation plante-pathogènes : mode d’infection, virulence, réactions de la plante, relation «géne pour gène ». Maladies fongiques, Maladies  bactériennes, Maladies  virales, Maladies  à viroïdes, Epidémiologie, Méthodes de lutte : chimique, biologique, intégrée, raisonnée, résistance génétique.
- Cours phytochimie : molécules du métabolisme secondaire. biosynthèse, extraction, caractérisation, activité
- TP : Analyse sanitaire du Pelargonium vis à vis de Xanthomonas campestris pv pelargonii   (Coupes histologiques de tiges, recherche de symptômes, Extraction de bactéries du matériel végétal, Isolement sur boites, galeries API, Test d’immunoflurescence).
- TP : Etude de la l’effet de composés du métabolisme secondaires sur la germination des graines, le développement bactérien : Extraction de molécules de clou de girofle et de tabac, test sur graines de culture et d’adventices et sur souches bactériennes en boite de Pétri.
- Analyse sanitaire du Chrysanthème vis-à-vis du CAV (2) : analyse des plants obtenus par culture de méristèmes par test  ELISA.

Techniques :
- Biologie moléculaire (Southern blot, dot blot, PCR)
- Tests phytosanitaires (avec mesures de sécurité collectives & individuelles)
- Biochimie, chromatographie, microbiologie
- Immunofluorescence, ELISA, Histologie végétale
- Contention d’animaux de laboratoires (souris) et chirurgie sur ces animaux, avec entrainement préalable (chaussettes)
- Test normalisé de tératologie : injections, dissection, analyse des malformations foetales

Type		Libellé	Nature	Coef.

• Agronomie (au semestre 4 [UE Obligatoire]) [mention : Génie biologique]