- Domaine : Licences du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
- Diplôme : Licence
- Mention : Sciences de la Vie
- Parcours : Bio-informatique, statistique et modélisation
- Unité d'enseignement : Génétique et dynamique des populations
Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BIO3019L
UE Libre pour ce parcours
UE valable pour le semestre 5 de ce parcours
Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
28.5 h
Travaux Dirigés (TD)
21 h
Travaux Pratiques (TP)
6 h
Total du volume horaire
55.5 h
* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.
Conditions d'accès à l'UE :
UE recommandée : Génétique 2
Programme - Contenu de l'UE :
Objectifs : Acquisition des concepts théoriques et des outils d'analyse de la Génétique et Dynamique des Populations : étudier comment les populations s'organisent dans la nature et analyser l'évolution de leurs structures, de leurs effectifs et de la fréquence des gènes au cours du temps. Une introduction aux mécanismes génétiques des phénomènes d'adaptation et de spéciation est présentée. Le fonctionnement des populations est étudié en prenant en compte la complexité de l'environnement dans lequel elles évoluent (structuration spatiale et temporelle, structure des communautés, effets et variations des facteurs abiotiques et anthropiques). Fournir les bases conceptuelles nécessaires à la compréhension de l'Ecologie Evolutive (UE de M1) et à la gestion des populations (contrôle, conservation) (UE “ Structures, Gestion et Conservation des Populations †, L3 BOP). Cours : Génétique des populations: Les marqueurs génétiques et leurs utilisations (RFLP, RAPD, AFLP, microsatellites, SSCP, SNP, etc). Processus déterministes (mutations, migrations, sélection mono et multi-locus, fréquence dépendante, multi-niche, de parentèle). Facteurs sélectifs, adaptations locales, coévolution. Processus stochastiques (dérive génétique, taille efficace). Maintien du polymorphisme (équilibre sélection-mutation, sélection à coefficients variables, corrélation génétique et trade-off). Interaction sélection-dérive - Introduction à la théorie de la coalescence. paysages adaptatifs de Wright. Différenciation génétique des populations et distance génétique. Isolement reproducteur (pré et post-zygotique) et mécanismes génétiques de la spéciation. Introduction à la Dynamique des Populations Définition et estimation des principaux paramètres biodémographiques d'une population à partir de modèles mathématiques déterministes en temps continu et discret (Matrice de Leslie). Mécanismes dépendants et indépendants de la densité. Les modèles mathématiques matriciels (Math Bio II) seront particulièrement étudiés. Travaux dirigés : Génétique des Populations: Transmission mono et multilocus (déséquilibre gamétique, D/Dmax, Lod score) Simulation des effets de la dérive génétique. Coefficient de consanguinité lié à la dérive. Estimation de la taille efficace Ne. Les différents modèles de sélection, estimation de la valeur sélective (intra et inter-génération). Equilibre sélection-mutation. Différenciation géographique et statistique F. Distance génétique. Interactions sélection, dérive, migration. Dynamique des Populations : Utilisation d'un modèle de base de Capture-Marquage-Recapture - Construction et interprétation d'une table de survie - Modélisation de la dynamique d'une population isolée et structurée en âge - Modélisation de la dynamique d'une métapopulation. Travaux pratiques : Mesure et analyse du polymorphisme par électrophorèse de protéines; marqueurs moléculaires - Structure Modèles d'estimation de la taille d'une population par capture marquage recapture
Compétences acquises :
Méthodologiques :
- mesure de la diversité génétique à différentes échelles et utilisation dans les domaines de l'environnement, la santé et l'agronomie -mesure et analyse du polymorphisme par différentes techniques moléculaires - fonctionnement génétique des populations en relation avec leur environnement - modélisation de l'évolution de la fréquence des gènes dans les populations
Techniques :
- utilisation de logiciel d'analyse de données en génétique - application des outils mahématiques et statistiques à la Biologie des Populations - technique d'échantillonnage d'une population - technique de Capture-Marquage-Recapture afin d'estimer une taille de population, sa structure en âge et la dispersion des individus.
Modalités de contrôle des connaissances et Compétences 2020-2021:
| Type | | Libellé | Nature | Coef. | |
|---|
| CT | Contrôle Terminal | CT : Genetique Dynamique Populations | Ecrit session 1 / Ecrit session 2 | 3 |
| CT | Contrôle Terminal | CT : Genetique Dynamique Populations | Ecrit session 1 / Ecrit session 2 | 3 |
Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
Date de la dernière mise-à-jour : 17/04/2018
SELECT * FROM parcours INNER JOIN ue_parcours ON PAR_ID_FK=PAR_ID INNER JOIN mention ON MEN_ID = PAR_MENTION_FK WHERE PAR_ACTIVATE = 0 AND UE_ID_FK='227' ORDER BY UE_ID_FK ASC, PAR_ID_FK ASC
