Université Lyon 1
Université de Lyon
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Langue des Descriptions :
  Etendu aux fiches UE.
  • Domaine : Licences du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
  • Diplôme : Licence
  • Mention : Sciences de la Vie
  • Parcours : Bio-informatique, statistique et modélisation
Le plus de l'université Lyon 1 :
L'université Lyon 1 a une longue histoire en analyse des données biologiques, avec la présence du Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive en son sein. Cette activité intense de recherche a permis de créer de nombreuses formations interconnectées sur place: la licence BISM et les Masters "Bioinformatique" et "Biodiversité, Ecologie, Evolution"  à l'université, la filière "Bioinformatique et Modélisation" à l'INSA, les cours de Biologie Médicale à l'ISTIL et les formations en statistiques médicales comme le Master Santé Publique, ou encore le Master de Mathématiques pour la Biologie et la Médecine...

Et si toutes ces formations fonctionnent, c'est aussi grâce à l'environnement professionnel lyonnais, très dynamique en bioinformatique et biostatistiques: Biomérieux, Sanofi Pasteur, Lyonbiopôle, Merial, Boiron, Alizé Pharma, Bioaster, Math-Pharma, PraBi...
    Présentation :
Modalité de formation :
  • Formation initiale
  • Formation continue
  • Formation accessible en VAE (Validation des Acquis de l'Expérience)
Formation diplomante
Nature de la Formation :
Diplôme national
Niveau de recrutement :
BAC, BAC+1, BAC+2
Niveau de sortie :
BAC+3
Durée de la formation :
6 semestres
Total du volume horaire :
1650h
Site web pour plus d'information :
https://lbbe.univ-lyon1.fr/-Licence-.html
Adresse web d'inscription : *
Lieux de formation :
Cette formation est dispensée principalement sur le(s) site(s) suivant(s) :
  • Villeurbanne - La Doua
Langues d'enseignement :
  • FR  Français
    Description de la formation :

Il s'agit d'une mention interdisciplinaire dont l'objectif est de former des étudiants:

  1. à établir le dialogue entre les Sciences de la Vie, les Mathématiques et l'Informatique puis à mettre en oeuvre des techniques adaptées.
  2. à analyser et interpréter des données biologiques puis en extraire des informations pertinentes en vue de la compréhension et de la modélisation des processus impliqués.

Cette formation prépare aux métiers de techniciens, ingénieurs ou chercheurs Bio-Informaticiens  Bio-Statisticiens et/ou Bio-Mathématiciens. Ces métiers en pleine expansion répondent à une demande toujours croissante de personnes aux compétences interdisciplinaires.

    Public concerné et pré-requis :
- Tous les étudiants bacheliers pour l'entrée en L1.
- En poursuite d'études ou en réorientation, tous les étudiants en biologie, santé, pharmacie, IUT, BTS, licence de maths/info, classes prépa: en fonction du niveau de l'étudiant, une équivalence pourra être obtenue avec une partie des enseignements.
    Compétences acquises dans cette formation :

Le fil conducteur des parcours "Bio-Informatique, Statistique et Modélisation" (BISM) est bien de donner aux étudiants les moyens d'analyser et d'interpréter des données biologiques à l'aide d'outils mathématiques (Modélisation, Statistiques,...) et informatiques appropriés.

Un tel enseignement inter disciplinaire permet donc de fournir aux étudiants certaines compétences, que l'on peut qualifier de transverses dans la mesure où elles sont communes à différentes unités d'enseignement de la formation.

Ces compétences générales peuvent être identifiées et classées comme suit, dans une liste qui ne se veut pas exhaustive mais indicatrice de la philosophie qui anime le parcours BISM :

  • Compétences d'analyse et de synthèse
  1. Comprendre et interpréter les demandes des biologistes en termes mathématiques et/ou informatiques.
  2. Savoir choisir les bons outils pour répondre à la demande des biologistes.
  3. Analyser et interpréter les données biologiques afin d'en extraire des informations en vue de la compréhension et de la modélisation des processus du vivant.
  • Compétences d'intégration disciplinaire
  1. Savoir naviguer d'une discipline à l'autre : maîtriser les bases de la Biologie, des Mathématiques et de l'Informatique.
  2. Etre capable de compléter ses connaissances dans l'une de ces trois disciplines, selon les besoins.
  3. Faire le lien entre les contenus de différentes disciplines.
  • Compétences méthodologiques
  1. Maîtriser la modélisation d'informations d'un point de vue informatique
  2. Concevoir et réaliser des développements informatiques
  3. Maîtriser les concepts de la programmation
  4. Manipuler des logiciels standard de Mathématiques et de Statistique
  5. Acquérir des données expérimentales
  6. Apprendre à conduire une démarche empirique
    Modalités d'inscription :
Pour toute insertion dans la filière en cours de 2ème année, en 3ème année, ou en ré-orientation après un IUT, des études de médecine, de maths-info, contacter  le responsable du parcours pour préparer en amont l'entrée dans le parcours.
    Modalités d'évaluation des connaissances :
Les modalités d'évaluation sont arrêtées annuellement par le Conseil d'Administration, sur proposition du Conseil des Etudes et de la Vie Universitaire. Pour 2015-2016:
- la compensation au sein du semestre pédagogique (30 ECTS) est automatique ;
- chaque année universitaire est validée par obtention des deux semestre sla composant; une moyenne supérieure à 9 à chaque semestre est requise pour qu'une compensation puisse avoir lieu.
- la licence est validée par obtention des 3 années universitaires la composant.

Les modalités de contrôle des connaissances à jour sont disponibles ici
    Effectifs des années antérieures :
Les effectifs de la licence BISM varient entre 15 et 30 étudiants chaque année. Cet effectif relativement léger permet une gestion plus personnalisée des étudiants, et des TP plus poussés.
    Taux de réussite des années antérieures :
L3 2010-2011: 81%
L3 2011-2012: 78%
L3 2012-2013: 86%
L3 2013-2014: 87%
L3 2014-2015: 57%
L3 2015-2016: 80%
    Intervenants :
Pour se faire une idée plus précise des contenus de la licence, une bonne idée est de contacter le/la responsable du parcours, ou les enseignants des 3 modules de S6 (Bioinformatique-BISM, Biostatistiques-BISM, Biomatematiques et Modélisation-BISM) pour en discuter avec eux.
    Responsabilité du Parcours :
DUFOUR ANNE BEATRICE
04.72.44.82.77
    Contact scolarité :
Scolarité de licence STS
 scolarite.licence.stsuniv-lyon1.fr
04.72.43.29.05
    Composante(s) de l'université responsable de cette formation :
UFR Biosciences (Biologie, Biochimie)
    Liste des Unités d'Enseignement (UE) :
UE survolée :
Validation pour 1 semestre (30 cts)
S1
Biomolécules A
6*
Géosciences 1
6*
Bases de physique pour les sciences de la vie et de la terre
6*
Diversité du vivant
6*
Transversale 1
6*
S2
Biomolécules B
6*
Génétique 1
6*
De la Cellule à l'Organisme
6*
Mathématiques pour les Sciences de la Vie
6*
Transversale 2
6*
S3
Biologie et modélisation
6*
Génétique 2
6*
Algorithmique programmation impérative, initiation
6*
Enzymologie et métabolisme
6*
Transversale 3
6*
S4
Biostatistiques et bioinformatique
6*
Enzymologie et métabolisme
6*
Algorithmique et programmation récursive
6*
Transversale 4
6*
Enzymologie et métabolisme
6*
S5
Outils et bases moléculaires
24*
Transversale 5
6*
S6
Conduite de projet
24*
UE Obligatoire
UE Optionnelle
UE Libre
* Nombre de crédits de l'UE
  • Semestre 1
  • Semestre 2
  • Semestre 3
  • Semestre 4
  • Semestre 5
  • Semestre 6
Semestre 1
Description:
Ce semestre est commun à toutes la licence de Biologie, quel que soit le parcours désiré.
Semestre 2
Description:
Ce semestre est commun à toutes la licence de Biologie, quel que soit le parcours désiré.
Semestre 3
Description:
Les choix d'optionnelles présentés ici sont indicatifs, et peuvent dépendre de contraintes d'emploi du temps ou de prérequis issus des années précédentes.
Semestre 4
Description:
Les choix d'optionnelles présentés ici sont indicatifs, et peuvent dépendre de contraintes d'emploi du temps ou de prérequis issus des années précédentes.
Semestre 5
Description:
Semestre 6
Description:
S1: Bloc 1 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Biomolécules A (6 ects)

S1: Bloc 2 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Géosciences 1 (6 ects)

S1: Bloc 3 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Bases de physique pour les sciences de la vie et de la terre (6 ects)

S1: Bloc 4 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Diversité du vivant (6 ects)

S1: Bloc 5 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Transversale 1 (6 ects)

S2: Bloc 1 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Biomolécules B (6 ects)

S2: Bloc 2 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Génétique 1 (6 ects)

S2: Bloc 3 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
De la Cellule à l'Organisme (6 ects)

S2: Bloc 4 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Mathématiques pour les Sciences de la Vie (6 ects)

S2: Bloc 5 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Transversale 2 (6 ects)

S4: Bloc 1 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Biostatistiques et bioinformatique (6 ects)

S4: Bloc 2 [UE Optionnelle] (6 Crédits) :
Agriculture et Agronomie (6 ects)
Bases de données structurales 3D en biochimie (3 ects)
Biologie du développement (6 ects)
Botanique (6 ects)
Chimie Organique Fonctionnelle (6 ects)
Ecologie et informatique (6 ects)
Ecologie générale (6 ects)
Enzymologie et métabolisme (6 ects)
Génomes, Santé et Evolution - GSE (6 ects)
Informatique graphique en biochimie (3 ects)
Introduction à la biologie cellulaire et à l'immunologie (6 ects)
La réaction chimique (6 ects)
Microbiologie 1 (6 ects)
Microbiologie et société (6 ects)
Neurosciences (6 ects)
Physiologie animale (6 ects)
Physiologie végétale (6 ects)
Projet d'Intégration en Licence Professionnelle (6 ects)
Représentation 3D des macromolécules (3 ects)
Zoologie (6 ects)

S4: Bloc 3 [UE Libre] (6 Crédits) :
Algorithmique et Programmation Avancée (6 ects)
Algorithmique et programmation récursive (3 ects)
Base de données et Programmation WEB (6 ects)
Bases de l'architecture pour la programmation (3 ects)
Introduction aux réseaux et au web (3 ects)
Unix (3 ects)

S4: Bloc 4 [UE Obligatoire] (6 Crédits) :
Transversale 4 (6 ects)

S4: Bloc 5 [UE Optionnelle] (6 Crédits) :
Agriculture et Agronomie (6 ects)
Bases de données structurales 3D en biochimie (3 ects)
Biologie du développement (6 ects)
Botanique (6 ects)
Chimie Organique Fonctionnelle (6 ects)
Ecologie et informatique (6 ects)
Ecologie générale (6 ects)
Enzymologie et métabolisme (6 ects)
Génomes, Santé et Evolution - GSE (6 ects)
Informatique graphique en biochimie (3 ects)
Introduction à la biologie cellulaire et à l'immunologie (6 ects)
La réaction chimique (6 ects)
Microbiologie 1 (6 ects)
Microbiologie et société (6 ects)
Neurosciences (6 ects)
Physiologie animale (6 ects)
Physiologie végétale (6 ects)
Projet d'Intégration en Licence Professionnelle (6 ects)
Représentation 3D des macromolécules (3 ects)
Zoologie (6 ects)

    Commentaire sur les statistiques d'insertion :
La grande majorité des étudiants poursuivent en Master. La licence n'étant pas une licence professionnelle, elle n'a pas pour objectif de permettre aux étudiants une insertion directe sur le marché du travail.
    Poursuites d'études et débouchés :

Poursuite d'études

En termes de poursuite d'études, des Masters Professionnels ou Recherche sont les débouchés naturels de ce parcours, en France et à l'étranger (Barcelone, Heidelberg, Cambridge). En particulier le Master Bioinformatique est dans la directe continuité de la licence BISM, tout comme le Master Biodiversité, Ecologie, Evolution et également la mention Biostatistiques (B3S) du Master de Santé Publique. La possibilité de rejoindre un cursus d'école d'ingénieur (par exemple l'INSA de Lyon) existe aussi avec un excellent dossier.

 

Débouchés

La formation "BISM"  dans son ensemble prépare à un large éventail de métiers dans de nombreux secteurs professionnels, soit directement, soit après une formation complémentaire pour acquérir une double compétence.

De nombreux secteurs professionnels sont concernés.

Du côté de la recherche et du secteur public, la formation "BISM" permettra aux étudiants d'intégrer des laboratoires d'écologie, environnement, génomique, bio-mathématique, bio-statistique, bio-informatique,..., en tant que chercheurs ou maîtres de conférences. Le besoin d'enseignants dans les domaines auxquels prépare cette formation risque de se faire de plus en plus ressentir dans la mesure où les secteurs d'activités concernés sont actuellement en plein développement.

Du côté du secteur privé, il existe actuellement une forte demande pour des étudiants au profil interdisciplinaire dans des secteurs comme les biotechnologies, la pharmacologie, mais aussi l'environnement et la biodiversité.

 

    Métiers (en référence à www.vocasciences.fr ) :
Au vue des connaissances et des compétences acquises durant la formation, des stages réalisés et/ou des concours réussis, les diplômés de cette formation peuvent prétendre aux métiers suivants :
 Administrateur de logiciel de laboratoire 
 Animateur scientifique 
 Attaché de Recherche Clinique 
 Bio-informaticien 
 Biostatisticien 
 Chargé de recherche 
 Chef de projet pharmaceutique 
 Chercheur en biologie 
 Contrôleur de la répression des fraudes 
 Data-manager 
 Développeur 
 Enseignant chercheur 
 Gestionnaire de bases de données cliniques 
 Ingénieur d'études techniques 
 Ingénieur de recherche 
 Ingénieur statisticien 
    Secteurs disciplinaires concernés :
  • Biologie - Biochimie
  • Environnement - Ecologie
  • Informatique
  • Mathématiques
  • Médecine
  • Pharmacie - Cosmétologie
    Activités socio-économiques en lien avec la formation :
  • Biotechnologies
  • Environnement - Ecologie
  • Pharmacie - Cosmétologie
  • Agroalimentaire - Agronomie
  • Recherche et développement scientifique
Date de la dernière mise-à-jour : 18/05/2021