Domaine : Licences du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
Diplôme : Licence
Mention : Sciences de la Vie
Parcours : Bio-informatique, statistique et modélisation
Unité d'enseignement : Mathématiques appliquées à la biologie
Nombre de crédits de l'UE : 6 Code APOGEE : BIO3025L UE Libre pour ce parcours UE valable pour le semestre 5 de ce parcours
Responsabilité de l'UE :
AMAT ISABELLE
isabelle.amatuniv-lyon1.fr
04.72.43.26.33
Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
24 h
Travaux Dirigés (TD)
30 h
Travaux Pratiques (TP)
0 h
Total du volume horaire
54 h
* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.
Conditions d'accès à l'UE :
UE recommandées : Mathématiques pour les Sciences de la Vie 1 (L1), Bio-statistiques et Bio-informatique (L2)
Programme - Contenu de l'UE :
Objectif : acquisition des méthodes mathématiques et statistiques indispensables à la compréhension et à l'analyse des phénomènes biologiques. Présentation des concepts mathématiques impliqués dans la modélisation de l’évolution des systèmes biologiques au cours du temps. L’analyse des systèmes biologiques structurés en plusieurs classes (classes d’âge, génotypes, localités géographiques, …) fait appel à des outils relevant de l’algèbre linéaire, dont les concepts de base seront présentés (système de vecteurs, applications linéaires, changement de base, produit matriciel, diagonalisation). Les étudiants seront familiarisés avec leur utilisation pour la biologie. Les étudiants seront ensuite formés à l’analyse de systèmes d’équations différentielles ordinaires (EDO) pour modéliser une variable biologique (e.g. une densité de population) ou deux variables en interaction (e.g. pour modéliser les interactions entre deux espèces) au cours du temps (typologie des systèmes linéaires, isoclines zéros, portrait de phase en dimension 2). Les étudiants mettront en pratique ces outils de modélisation en TD sur la base de problématiques empruntées à différents domaines de la biologie (une partie des TD se fera sur machine). Statistique : raisonnement commun aux tests d'hypothèses (distribution de la statistique, vraisemblance, décision et risque d’erreur) en vue de préparer l’étudiant à l’apprentissage en autonomie de nouveaux tests d’hypothèses (Applications notamment aux statistiques non paramétriques). Les TD de statistiques se font sur ordinateur en utilisant le logiciel de statistique R sur la base de jeux de données biologiques concrets. Un TD sera consacré à l’utilisation des outils d’algèbre linéaire cités ci-dessus en statistique pour étudier la structuration de jeux de données multivariés.
Modalités de contrôle des connaissances et Compétences 2020-2021:
Type
Libellé
Nature
Coef.
CT
Contrôle Terminal
CT : Mathematiques appliquees biologie
Ecrit session 1 / Ecrit session 2
3.6
CC
Contrôle Continu
CC : Mathematiques appliquees biologie
Contrôle Continu
2.4
Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
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