Université Lyon 1
Université de Lyon
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  • Domaine : Masters du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
  • Diplôme : Master
  • Mention : Bio-informatique
  • Parcours : Bio-informatique moléculaire: méthodes et analyses
  • Unité d'enseignement : Bioinformatique Structurale
Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BCH1003M
UE Obligatoire pour ce parcours
UE valable pour les semestres 1, 3 de ce parcours
    Responsabilité de l'UE :
DELEAGE GILBERT
 gilbert.deleageuniv-lyon1.fr
04.72.72.26.55
    Contact scolarité :
Département Chimie Scolarite
 scolarite.chimieuniv-lyon1.fr
04.72.43.26.39
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
26 h
Travaux Dirigés (TD)
6 h
Travaux Pratiques (TP)
16 h
Total du volume horaire
48 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Conditions d'accès à l'UE :

    Programme - Contenu de l'UE :

Cette UE suit la logique de l’UE IBIS de Licence (bioinformatique des séquences).

Maîtrise du contenu et de l’interrogation des banques de données de structures protéiques. Maîtrise des méthodologies et de l’utilisation courante des logiciels d’analyses de prédiction de structures et de modélisation moléculaire des protéines. Simulations en dynamique moléculaire. Interactions protéineligands.


Travaux Pratiques 

- TP N°1 Modélisation moléculaire de protéines par homologie avec SPDBV et geno3D

- TP N°2 Validation et analyse structurale des protéines

- TP N°3 Recherche et analyse de sites fonctionnels dans les structures 3D de protéines

    Compétences acquises :
Méthodologiques :
Modélisation moléculaire de protéines par homologie.
Validation et analyse structurale des protéines.
Recherche et comparaison de sites fonctionnels dans la structure 3D de protéines.

Utilisation du logiciel SYBYL

Techniques :
Bioanalyse des données de structures 3D de protéines. Modélisation moléculaire. « Drug design »

    Modalités de contrôle des connaissances et Compétences 2020-2021:
TypeLibelléNatureCoef. 
CTContrôle TerminalCT : Bioinformatique structuraleEcrit session 1 / Ecrit session 23.6
CTContrôle TerminalCT : Bioinformatique structuraleTravaux pratiques2.4
    Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
Date de la dernière mise-à-jour : 14/11/2020
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